蝙蝠和嚙齒動(dòng)物等疫源野生動(dòng)物在人畜共患病原體的傳播中扮演著(zhù)重要角色。某些非洲國家和地區是野生動(dòng)物源新發(fā)傳染病發(fā)生的熱點(diǎn)區域，然而當地公共衛生基礎設施相對薄弱，導致這些地區的傳染病監測和防控面臨挑戰。調查這些地區的病毒在野生動(dòng)物種群中的分布、進(jìn)化和傳播方式是預警預防未來(lái)潛在流行病威脅的關(guān)鍵步驟。

中國科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗研究員團隊與深圳華大生命科學(xué)研究院、昆士蘭大學(xué)和肯尼亞國家博物館等單位合作，對在東非國家肯尼亞和烏干達采集的近1300份蝙蝠和嚙齒動(dòng)物樣本進(jìn)行了病毒組調查研究?；谌A大智造T系列測序平臺，研究團隊通過(guò)宏轉錄組測序揭示了這些野生動(dòng)物中的病毒多樣性，重組和跨地域傳播特征。相關(guān)研究成果于近日在國際期刊Microbiome（《微生物組》）發(fā)表。

本研究使用的動(dòng)物樣本種類(lèi)與分布

研究團隊共鑒定出251種蝙蝠或嚙齒動(dòng)物攜帶的RNA和DNA病毒，其中87%為新病毒，揭示了東非地區野生動(dòng)物高度的病毒多樣性和獨特性。值得關(guān)注的是，在埃及果蝠中發(fā)現了與人類(lèi)II型副流感病毒和人類(lèi)軟疣病毒相近緣的病毒，這些發(fā)現不僅對于理解這些病毒的起源有重要意義，也為研究它們的傳播機制提供了關(guān)鍵線(xiàn)索。

東非蝙蝠和嚙齒動(dòng)物病毒多樣性

此外，該研究顯示冠狀病毒和圓環(huán)病毒在與細胞入侵相關(guān)的蛋白上有著(zhù)高度的多樣性和頻繁的重組。進(jìn)一步分析揭示了病毒群落中頻繁發(fā)生重復突變、不同病毒型別的共感染以及地域間的病毒流動(dòng)，這些因素共同促進(jìn)了多樣化的自然病毒群落，為理解病毒如何在不同生態(tài)系統中傳播提供了重要信息。

東非哺乳動(dòng)物病毒與動(dòng)物宿主間的網(wǎng)絡(luò )關(guān)系

該研究成果為揭示東非地區蝙蝠、嚙齒類(lèi)等重點(diǎn)疫源野生動(dòng)物宿主的病毒譜提供了全面的基因組和生態(tài)數據資源，也為全球病毒多樣性研究領(lǐng)域提供了新的數據和視角。

該研究受到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃，廣東省高通量基因組測序與合成編輯應用重點(diǎn)實(shí)驗室項目，國家科技重大專(zhuān)項、中國科學(xué)院中-非聯(lián)合研究中心項目以及中國科學(xué)院國際伙伴計劃項目的經(jīng)費支持。華大生命科學(xué)研究院王達希副研究員、中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所楊興婁研究員、華大生命科學(xué)研究院任梓睿、中國科學(xué)院武漢病毒研究所胡犇青年研究員，華大生命科學(xué)研究院趙海龍博士為本文共同第一作者。中國科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗研究員，華大生命科學(xué)研究院李俊樺研究員，昆士蘭大學(xué)Sheila Ommeh教授，肯尼亞國家博物館Bernard Agwanda研究員以及華大生命科學(xué)研究院肖敏鳳副研究員為本文共同通訊作者。