科研進(jìn)展
精密測量院與北京大學(xué)合作 在GPCR-β-arrestin信號通路動(dòng)態(tài)研究中取得新進(jìn)展
11月29日,精密測量院胡蘊菲、李從剛課題組聯(lián)合北京大學(xué)金長(cháng)文課題組在GPCR- -arrestin信號通路動(dòng)態(tài)研究中取得新進(jìn)展,首次在殘基水平上展示了PIP2獨立激活 -arrestin蛋白的特有機制,并檢測到了可能代表了激活中間態(tài)的低比例構象。相關(guān)研究近日在國際期刊《自然通訊》(Nature Communications)上在線(xiàn)發(fā)表。
G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)是最大的細胞膜表面受體家族和最重要的藥物靶標。 -arrestin蛋白是GPCR信號傳導途徑下游的支架蛋白和信號調節因子,它能被磷酸化的GPCR激活,參與GPCR的脫敏、內吞、循環(huán)等生理過(guò)程,并能夠介導獨立于G蛋白的細胞內信號通路,對多種重要疾病的進(jìn)程有重要影響。在人體中僅存在兩種 -arrestin蛋白,它們不僅要接收來(lái)自800多種不同的GPCR所傳遞的信號,還能夠引發(fā)多樣的下游效應。 -Arrestin蛋白功能上的多樣性是由于其結構的高度動(dòng)態(tài)性。目前,盡管 -arrestin蛋白在非激活態(tài)和激活態(tài)結構是已知的,但它們僅代表了起始終止時(shí)的穩定構象;而對 -arrestin蛋白激活過(guò)程中的構象動(dòng)態(tài)變化,尤其是對受體磷酸化尾巴和細胞膜磷脂組分引起 -arrestin的激活機制的異同,仍然缺乏足夠的理解。國際上對相關(guān)方面的研究尚處于起步階段。
-arrestin-1蛋白突變體庫的構建和本論文研究的不同功能狀態(tài)
19F NMR方法檢測 -arrestin-1蛋白動(dòng)態(tài)構象變化
19F NMR方法揭示PIP2激活 -arrestin-1蛋白的分子機制
液體核磁共振方法能夠在原子分辨率水平上研究蛋白質(zhì)相互作用和構象變化,提供靜態(tài)結構中缺失的信息,是研究GPCR- -arrestin信號通路動(dòng)態(tài)結構變化與激活機制不可缺少的核心手段。該項研究對 -arrestin-1蛋白進(jìn)行了系統突變,構建了一個(gè)覆蓋所有重要結構區域的突變體庫(圖一),進(jìn)而引入新型19F同位素探針,檢測 -arrestin-1在結合不同的受體磷酸化肽段和細胞膜上的4,5-二磷酸磷脂酰肌醇(PIP2)時(shí)的核磁圖譜變化(圖二),分析 -arrestin-1與不同組分結合時(shí)產(chǎn)生的構象變化,揭示了兩種不同激活模式的分子機制。該項研究首次在殘基水平上展示了PIP2 獨立激活 -arrestin蛋白的特有機制(圖三),并檢測到了可能代表了激活中間態(tài)的低比例構象。研究還揭示了PIP2 、受體磷酸化肽段以及磷脂雙分子層在調控 -arrestin-1構象平衡中的相互關(guān)系,揭示了 -arrestin蛋白功能多樣性的分子機制,為進(jìn)一步針對該通路進(jìn)行基于動(dòng)態(tài)結構的藥物研發(fā)提供了理論基礎。
該研究以“應用19F核磁共振方法揭示 -抑制蛋白不同激活機制(Distinct activation mechanisms of -arrestin 1 revealed by 19F NMR spectroscopy)” 為題在《自然通訊》(Nature Communications)上發(fā)表。由北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士生翟睿博(第一作者)在教授金長(cháng)文和研究員胡蘊菲(共同通訊作者)的共同指導下完成。分子動(dòng)力學(xué)模擬工作由北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院博士生王卓琦完成。新型19F探針由精密測量院研究員李從剛和博士柴兆斐提供。19F CEST NMR實(shí)驗由北京大學(xué)核磁共振中心博士牛曉剛完成。該研究得到了武漢-北京磁共振聯(lián)合實(shí)驗室的大力支持。
論文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41467-023-43694-1