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科研進(jìn)展

水生所發(fā)現藍細菌中首個(gè)乙酰轉移酶并揭示其功能和分子作用機制

發(fā)表日期:2023-10-11楊明坤來(lái)源:水生生物研究所放大 縮小

  賴(lài)氨酸乙?;揎検侵匾牡鞍踪|(zhì)翻譯后修飾之一,通常指的是乙?;鶊F從乙酰輔酶AAcetyl-COA)轉移到蛋白質(zhì)特定的賴(lài)氨酸 -氨基上,形成乙?;馁?lài)氨酸。賴(lài)氨酸乙?;ǔJ艿劫?lài)氨酸乙酰轉移酶和去乙?;傅恼{控,從而改變蛋白的結構與功能,對細胞代謝、轉錄活性、蛋白質(zhì)穩定性、信號通路等眾多重要的生理功能進(jìn)行精細的調節與控制。中國科學(xué)院水生生物研究所葛峰研究員和趙進(jìn)東院士團隊前期發(fā)現藍細菌中很多蛋白都會(huì )發(fā)生乙?;揎?,其中光合系統II蛋白PsbO的乙?;揎椏梢载撜{控光合放氧(Molecular & Cellular Proteomics, 2017, 16(7):1297-1311);藍細菌中的乙?;揎検艿饺ヒ阴;?span style="line-height: 150%">CddA的調控,該酶能夠通過(guò)去除底物蛋白的乙?;揎梾⑴c藍細菌的光合作用過(guò)程(Plant Physiology, 2020, 184(2):762-776)。由于賴(lài)氨酸乙?;揎検强赡娴?,那么,藍細菌中是否存在乙酰轉移酶? 

  為回答這一重要科學(xué)問(wèn)題,該團隊對模式藍細菌Synechococcus sp. PCC 700216個(gè)預測的乙酰轉移酶進(jìn)行系統篩選,通過(guò)體內和體外實(shí)驗首次鑒定到一個(gè)乙酰轉移酶cGNAT2,該基因敲除后導致藍細菌的光合作用受到顯著(zhù)影響,提示cGNAT2可能通過(guò)調控底物蛋白乙?;揎梾⑴c藍細菌的光合作用進(jìn)程。 

1. 藍細菌賴(lài)氨酸乙酰轉移酶cGNAT2的功能研究

  為了闡明cGNAT2潛在的催化機制,該團隊利用AlphaFold2預測了cGNAT2的結構,發(fā)現該蛋白是一個(gè)同源二聚體的結構,由7個(gè) 折疊和4個(gè) 螺旋結構組成,形成一個(gè)管狀口袋,能夠與底物蛋白以及Acetyl-COA結合進(jìn)而發(fā)揮催化作用;通過(guò)分子對接進(jìn)一步確定了cGNAT2Acetyl-COA之間的結合區域,并結合位點(diǎn)突變與體外酶活性實(shí)驗證實(shí)了有8個(gè)氨基酸殘基是維持酶活性的關(guān)鍵位點(diǎn)(圖2)。 

2. cGNAT2的結構與催化活性

  為了揭示cGNAT2的分子作用機制,通過(guò)采用乙?;贵w富集和非標記定量乙酰組學(xué)技術(shù),系統鑒定到548個(gè)cGNAT2調控的內源性靶標修飾蛋白,這些蛋白廣泛分布于光合作用以及能量代謝通路中,表明cGNAT2調控的乙?;揎椩诠夂舷到y以及能量代謝等生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著(zhù)重要的調控作用(圖3)。 

3. cGNAT2調控的內源性靶標蛋白鑒定 

  進(jìn)一步的功能實(shí)驗發(fā)現,在光合作用通路中NdhJNDH脫氫酶亞基J)是cGNAT2的靶標底物,cGNAT2能夠在體內和體外催化NdhJ的第89位乙?;揎?,進(jìn)而調控NdhJ的酶活性,并影響光合電子傳遞(圖4)。 

4. cGNAT2調控NdhJ蛋白的乙?;揎椷M(jìn)而影響光合作用過(guò)程

  該研究首次在藍細菌中發(fā)現了賴(lài)氨酸乙酰轉移酶cGNAT2,并闡明了cGNAT2在藍細菌中通過(guò)調控底物蛋白的乙?;揎椷M(jìn)而實(shí)現其功能的分子機制(圖5),對理解蛋白翻譯后修飾在光合作用過(guò)程中的調控機理具有重要意義。 

5. cGNAT2在藍細菌中調控生長(cháng)和光合作用的分子機制模型

  該研究成果Deciphering structure, function, and mechanism of lysine acetyltransferase cGNAT2 in cyanobacteria在線(xiàn)發(fā)表于Plant Physiology雜志,博士生賈坤、高級實(shí)驗師楊明坤博士為該論文的并列第一作者,葛峰研究員、趙進(jìn)東院士為共同通訊作者,該研究得到自然科學(xué)基金和國家重點(diǎn)研發(fā)計劃的資助。文章鏈接:https://doi.org/10.1093/plphys/kiad509 

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