吸血節肢動(dòng)物中傳播循環(huán)的病毒有兩大類(lèi):蟲(chóng)媒病毒(arbovirus)和節肢動(dòng)物特異性病毒(arthropod-specific virus, ASV)。蟲(chóng)媒病毒能在脊椎動(dòng)物和節肢動(dòng)物中復制,對人類(lèi)或動(dòng)物具有致病性,給全球公共衛生來(lái)沉重負擔。節肢動(dòng)物特異性病毒僅在節肢動(dòng)物中復制,它們可能是蟲(chóng)化病毒進(jìn)化的起源。然而,目前沒(méi)有涵蓋所有已知蟲(chóng)媒病毒和節肢動(dòng)物特異病毒種類(lèi)、生物安全風(fēng)險等級、基因組節段、地理分布等信息的綜合數據集。
2023年5月19日,國際學(xué)術(shù)期刊Scientific Data在線(xiàn)發(fā)表了武漢病毒所/生物安全大科學(xué)中心袁志明/夏菡團隊在蟲(chóng)媒病毒生態(tài)健康和生物安全領(lǐng)域的最新研究論文,文章題為“A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus”(全球蟲(chóng)媒病毒和節肢動(dòng)物特異病毒的序列、多樣性及生物安全風(fēng)險綜合數據集)。研究人員通過(guò)整合美國CDC蟲(chóng)媒病毒名錄(Arbovirus Catalog)、第六版《微生物和生物醫學(xué)實(shí)驗室生物安全》(BMBL 6th)附錄VIII-F、國際病毒分類(lèi)委員會(huì )(ICTV)的病毒分類(lèi)信息以及Genbank序列等有關(guān)信息,提取分類(lèi)學(xué)、生物安全風(fēng)險、基因節段、核酸和氨基酸序列、地理分布等,構建了首個(gè)全球蟲(chóng)媒病毒和節肢動(dòng)物特異病毒的綜合數據集。
該數據集包含了(1)615個(gè)蟲(chóng)媒病毒(460個(gè)病毒種),98,994條記錄和190個(gè)節肢動(dòng)物特異病毒(180個(gè)病毒種),2,100條記錄,共包括34個(gè)病毒科,89個(gè)病毒屬和640個(gè)病毒種(圖1a)。本研究詳細展示了蟲(chóng)媒病毒和節肢動(dòng)物特異病毒間的基因組節段差異(圖1b)、生物安全風(fēng)險建議等級(圖1c)、病毒及其節肢動(dòng)物媒介的全球分布、宿主來(lái)源等特征(圖1d)。為深入理解蟲(chóng)媒病毒和節肢動(dòng)物特異病毒的相互作用、進(jìn)化規律和風(fēng)險評估提供了豐富的數據資源(圖2)。
武漢病毒所博士后黃英、博士研究生汪順龍和山東理工大學(xué)副教授劉紅為論文共同第一作者,武漢病毒所夏菡青年研究員和浙大城市學(xué)院明朝燕副教授為論文共同通訊作者,武漢病毒所袁志明研究員、美國德州大學(xué)醫學(xué)分部Sergio Rodriguez助理教授為該項研究的合作作者。該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項目、國家自然科學(xué)基金項目和中科院中非中心項目等項目的資助。

圖1. 蟲(chóng)媒病毒和節肢動(dòng)物特異病毒的分類(lèi)、基因組節段和生物安全分級建議和宿主來(lái)源
圖2. figshare數據集部分信息
文章鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41597-023-02226-8
數據鏈接:
https://figshare.com/articles/dataset/A_global_dataset_of_viral_sequence_diversity_and_distribution_of_arboviruses_and_arthropod-specific_viruses/22154573?file=40281991