科研進(jìn)展
鯽(Carassius auratus)廣泛分布于青藏高原以外的東亞地區,現已成為青藏高原分布最廣的外來(lái)魚(yú)類(lèi)之一。在原產(chǎn)地,鯽魚(yú)存在有性生殖的二倍體和單性生殖的三倍體(胚胎基因組來(lái)源于卵子,精子雖然激活卵子啟動(dòng)胚胎發(fā)育但不貢獻其DNA)兩種形式,是研究不同生殖方式生物在入侵過(guò)程中遺傳適應的理想對象。
近期,中國科學(xué)院水生生物研究所陳毅峰團隊以西藏外來(lái)種群和原產(chǎn)地種群為研究對象,利用全基因組重測序數據開(kāi)展種群基因組研究,揭示了不同倍性鯽魚(yú)入侵西藏的基因組進(jìn)化模式。研究發(fā)現,盡管二倍體外來(lái)種群來(lái)源于兩個(gè)具有顯著(zhù)遺傳分化的遺傳聚類(lèi),且具有比這兩個(gè)遺傳聚類(lèi)更高的種群遺傳多樣性,但在個(gè)體水平上,外來(lái)個(gè)體的基因組觀(guān)測雜合度比原產(chǎn)地個(gè)體減少了21.4%。此外,西藏外來(lái)種群?jiǎn)为毿纬梢粋€(gè)遺傳聚類(lèi),與原產(chǎn)地種群之間產(chǎn)生了顯著(zhù)的遺傳分化(圖1)。
圖1 基于基因組SNPs的鯽魚(yú)種群遺傳多樣性(a)和個(gè)體遺傳多樣性(b)及二倍體(c)和三倍體(d)的種群遺傳結構。LL和CBL為外來(lái)種群
在二倍體外來(lái)種群中檢測發(fā)現的近交、奠基者效應和選擇性清除是導致個(gè)體遺傳多樣性降低和遺傳結構變化的主要因素。而三倍體外來(lái)種群由于雌核發(fā)育的單性生殖方式產(chǎn)生相同基因型子代,使其避免或降低了近交和奠基者效應對遺傳變異的影響,外來(lái)個(gè)體的遺傳多樣性與原產(chǎn)地個(gè)體相比未發(fā)生變化,外來(lái)種群與原產(chǎn)地種群之間也未形成遺傳分化。因此,遺傳變異在二倍體鯽魚(yú)的入侵過(guò)程中可能發(fā)揮相對更大的作用。從基因組進(jìn)化的角度分析,鯽魚(yú)的單性生殖種群比有性生殖種群在新環(huán)境的適應能力更強。研究還發(fā)現,選擇性清除區域的基因在功能上主要與胚胎發(fā)育和甘露糖苷酶活性有關(guān),它們可能在二倍體鯽魚(yú)適應高原極端環(huán)境過(guò)程中發(fā)揮重要作用。
圖2 拉魯濕地國家級自然保護區
對西藏外來(lái)鯽魚(yú)引入來(lái)源和倍性調查發(fā)現,西藏市場(chǎng)的鯽魚(yú)主要通過(guò)青藏公路和川藏公路分別從寧夏和四川的水產(chǎn)品市場(chǎng)中引入,由于宗教放生和養殖逃逸等原因進(jìn)入西藏自然水體。拉魯、茶巴朗和扎西崗三個(gè)濕地中二倍體鯽魚(yú)數量占鯽魚(yú)總數量的百分比分別為60.9%、3.1%和0%,倍性分布與濕地的開(kāi)放狀態(tài)相關(guān)。拉魯濕地(圖2)自上世紀九十年代末成為自然保護區以后不對外開(kāi)放,鯽魚(yú)不能夠通過(guò)放生的方式直接進(jìn)入濕地;而茶巴朗和扎西崗是開(kāi)放性濕地,通過(guò)放生鯽魚(yú)可以直接進(jìn)入濕地。隨著(zhù)我國魚(yú)類(lèi)育種和養殖業(yè)的快速發(fā)展,市場(chǎng)上的三倍體鯽魚(yú)占絕對優(yōu)勢,因此形成開(kāi)放性濕地的鯽魚(yú)以三倍體為主的現象。
上述研究成果以“Genetic responses in sexual diploid and unisexual triploid goldfish (Carassius auratus) introduced into a high-altitude environment”和“Genetic diversity and population structure of the invasive populations of goldfish Carassius auratus complex in Tibet”為題分別發(fā)表在期刊Molecular Ecology和Biological Invasions上。水生所馮秀助理研究員為論文的第一作者,陳毅峰研究員和隋曉云高級實(shí)驗師為論文的共同通訊作者。該研究得到第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究(2019QZKK0501和2019QZKK0304)、國家自然科學(xué)基金(31601844)和中國科學(xué)院戰略性先導科技專(zhuān)項(XDA20050204)等項目資助。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/mec.16864; https://link.springer.com/article/10.1007/s10530-023-03027-1