東亞是世界淡水魚(yú)類(lèi)多樣性最豐富的地區之一，形成了以鯉科（參考《中國動(dòng)物志: 硬骨魚(yú)綱. 鯉形目》的分類(lèi)系統）魚(yú)類(lèi)為主體的獨特的魚(yú)類(lèi)構成。其中，一類(lèi)被稱(chēng)為“東亞鯉”的類(lèi)群（約154種）最為特殊，它們占據了季風(fēng)區大量的生態(tài)空間，表現出對河流-湖泊生態(tài)系統的高度適應。這些魚(yú)類(lèi)不僅成為東亞國家淡水養殖的重要對象，如青、草、鰱、鳙、鳊、鲌、鲴、赤眼鱒等，還在世界各地的淡水水域中造成了嚴重的生態(tài)入侵。以往基于分子系統學(xué)的觀(guān)點(diǎn)認為，東亞鯉是東亞季風(fēng)活動(dòng)的產(chǎn)物。然而，這些研究關(guān)于東亞鯉的進(jìn)化時(shí)間（如，推測的起源時(shí)間跨度從14.49到43.3百萬(wàn)年前不等）和進(jìn)化關(guān)系并沒(méi)有達成一致。因此，東亞鯉的起源和演化是否與東亞季風(fēng)相關(guān)仍需要評估。如果兩者有關(guān)系，在季風(fēng)的影響下，東亞鯉是如何形成當前的分布模式的？支撐東亞鯉伴隨季風(fēng)演化的潛在因素是什么？為了理解這些問(wèn)題，研究人員從生態(tài)地理、系統發(fā)育、宏觀(guān)進(jìn)化和比較基因組等角度對東亞鯉進(jìn)行了系統地調查。

　　研究顯示：

圖3 東亞鯉的宏進(jìn)化分析。（A）成種速率分析，紫色表示“河-湖”類(lèi)群。（B）DTT分析顯示東亞鯉在季風(fēng)增強期有明顯的形態(tài)快速分化。（C）支系間的分化（黑色）和擴散（紅色）事件也都在東亞季風(fēng)盛行期達到了最大。（D）東亞鯉的起源與擴散，箭頭的粗細表示擴散事件的強度。（E）各區域之間的物種擴散，圓圈的面積表示支系分化事件發(fā)生的頻次。 

　　3、為何東亞鯉在季風(fēng)區表現出如此高的優(yōu)勢呢？基于比較基因組學(xué)的研究發(fā)現，東亞鯉群體中與大腦等神經(jīng)系統功能相關(guān)的基因（包括環(huán)境感知和驚嚇?lè )磻S持等）在調控區存在大量的變異。這些遺傳變異是所有東亞鯉共享而其它鯉科魚(yú)類(lèi)中沒(méi)有的，涵蓋大量新出現的調控元件和保守元件的大片段特異突變。這意味著(zhù)東亞鯉在腦等神經(jīng)系統的調控層面發(fā)生了一些獨特的改變。事實(shí)上東亞鯉也確實(shí)比其它鯉科魚(yú)類(lèi)表現得更活躍、更敏感。因此，研究人員推測這些涉及大腦等神經(jīng)調控層面的“創(chuàng )新”可能有助于東亞鯉更好地應對季風(fēng)區水體環(huán)境的季節性變化。 

　　4、此外，研究人員還發(fā)現東亞鯉成員間存在十分普遍的基因流，這些基因流事件多發(fā)生于的古老的演化支系間。因此，研究人員推測這些古老的基因流也可能參與了東亞鯉的輻射。