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科研進(jìn)展

水生所研究揭示生物結皮微生物群落碳循環(huán)機制

發(fā)表日期:2022-06-02王瓊,李華來(lái)源:水生生物研究所放大 縮小

  土壤有機碳是地球表層陸地生態(tài)系統最大的碳庫,其動(dòng)態(tài)平衡不僅反映了生物群落組成和生態(tài)功能的變化,也深刻影響了生物圈溫室氣體的排放和氣候變化過(guò)程。在當前全球溫室效應日益顯著(zhù)的背景下,土壤碳庫研究逐漸成為了生態(tài)學(xué)領(lǐng)域關(guān)注的重點(diǎn)。土壤微生物是驅動(dòng)土壤碳轉化的關(guān)鍵類(lèi)群,盡管宏組學(xué)技術(shù)可通過(guò)基因豐度來(lái)預測物質(zhì)循環(huán)過(guò)程,但受制于微生物生理狀態(tài)、土壤有機質(zhì)化學(xué)結構類(lèi)型、有機碳氧化還原狀態(tài)差異等復雜因素的影響,在微生物群落水平上開(kāi)展土壤碳循環(huán)格局及過(guò)程的研究始終是一個(gè)難題。 

  在超過(guò)全球陸地面積40%的干旱區,由藍藻、地衣、苔蘚等隱花植物支撐的生物結皮群落(Biocrusts)分布廣泛。它們不僅能防風(fēng)固沙、成土培肥,還能促進(jìn)荒漠生態(tài)系統生物群落的發(fā)育演替,其特征明顯的初生演替過(guò)程是利用宏組學(xué)手段開(kāi)展土壤生物群落研究的理想模式材料。中國科學(xué)院水生生物研究所胡春香研究員團隊在前期多年研究工作基礎上,對典型野外樣地不同演替階段的生物結皮(藻結皮、藍藻地衣結皮、綠藻地衣結皮和蘚結皮)開(kāi)展了連續四年五批次的采樣調查工作,運用多種宏基因組技術(shù)及大數據模型分析手段,結合生理層面的酶活性測定和環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析,揭示了生物結皮群落微生物碳循環(huán)格局及其互作和調節機理。相關(guān)研究成果以“Carbon cycle in the microbial ecosystems of biological soil crusts”為題,近日在線(xiàn)發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊Soil Biology and BiochemistryDOI: 10.1016/j.soilbio.2022.108729)。 

  宏基因組的測序分析結果表明,耗能的光能驅動(dòng)的無(wú)機碳(Inorganic Carbon, IC)固定基因豐度較低,經(jīng)濟的化能驅動(dòng)的高分子有機碳降解、發(fā)酵、需氧呼吸和CO氧化基因較豐富。在有機碳的分解過(guò)程中,初期淀粉/糖原和纖維素的降解相關(guān)基因豐度更高,末期發(fā)酵相關(guān)基因的豐度更高。結合絕對定量的GeoChip分析及關(guān)鍵酶活性測定,發(fā)現在演替過(guò)程中無(wú)機碳固定、發(fā)酵、CH4氧化、淀粉/糖原和肽聚糖降解過(guò)程均呈下降趨勢,多個(gè)高效的IC固定途徑及CO氧化和大多類(lèi)型的有機碳降解呈增加趨勢。共現分析進(jìn)一步表明,生物結皮生態(tài)系統中的碳循環(huán)由類(lèi)似于初級生產(chǎn)的同化模塊和類(lèi)似于次級生產(chǎn)的異化模塊組成;隨演替,循環(huán)途徑與微生物群落組成之間的關(guān)系發(fā)生著(zhù)動(dòng)態(tài)變化,兩個(gè)模塊通過(guò)CBB循環(huán)、乙醇和丙酸發(fā)酵連接在一起,并被干旱度和鹽度平衡。以上研究結果深化了對生物結皮演替過(guò)程中碳循環(huán)途徑和調控機制的理解,并為深入揭示氣候變化條件下全球干旱區碳庫平衡動(dòng)態(tài)提供了研究基礎。 

  水生所王瓊博士為本論文第一作者、胡春香研究員為論文通訊作者,水生所張承才研究員、武漢理工大學(xué)張德祿教授參與了該項研究工作。該研究得到了國家自然科學(xué)基金(41877339)、中科院先導A項目(XDA17010502)及中科院特色研究所服務(wù)項目(Y85Z061601)的資助。

    文章鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071722001869 

1. 生物結皮群落中碳循環(huán)概念模型

2. 基于宏基因組測序的生物結皮的碳循環(huán);(aPCAPERMANOVA結果;(b)碳循環(huán)基因和途徑的相對豐度;右側分別為各無(wú)機碳固定(c)、CO氧化(d)、胞內復雜有機碳的降解(e)、胞外復雜有機碳降解(f)以及各發(fā)酵(g)途徑的相對豐度;A、C、G、M分別代表處于不同演替階段的四類(lèi)生物結皮

3. 基于GeoChip分析的關(guān)鍵基因或酶標準化平均信號強度;(a)無(wú)機碳固定、甲烷代謝以及CO氧化過(guò)程;(b)有機碳降解過(guò)程

4. 碳循環(huán)關(guān)鍵基因與屬水平高豐度微生物的共現性網(wǎng)絡(luò )

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